Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms