Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 BNC2-207ENST00000471301 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CASC15-202ENST00000561912 1449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC00929-202ENST00000556159 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL357137.1-201ENST00000604645 203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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