Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPOP42166 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms