Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms