Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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HOXA3O43365 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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HOXA3O43365 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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