Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM48Q8IWZ4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM48Q8IWZ4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM48Q8IWZ4 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM48Q8IWZ4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM48Q8IWZ4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM48Q8IWZ4 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM48Q8IWZ4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM48Q8IWZ4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM48Q8IWZ4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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