Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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