Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms