Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCNN1GP51170 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCNN1GP51170 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCNN1GP51170 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCNN1GP51170 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCNN1GP51170 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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