Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTLA4P16410 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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CTLA4P16410 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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