Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNAP12004 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNAP12004 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNAP12004 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNAP12004 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNAP12004 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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