Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM58BPP0C7Q3 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms