Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms