Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms