Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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