Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms