Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms