Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIP4K2AP48426 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms