Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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