Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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