Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms