Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms