Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms