Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms