Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC5Q9UQL6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC5Q9UQL6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms