Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms