Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms