Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf18Q9UK00 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms