Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSKSQ9UJT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSKSQ9UJT2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms