Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAX2Q9UIW0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAX2Q9UIW0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms