Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCOCQ9UIL1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCOCQ9UIL1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms