Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC3Q9UHC3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms