Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRRDQ9UH36 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms