Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCF2Q9UG63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms