Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN8Q9UBY8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN8Q9UBY8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms