Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM8A1Q9UBU6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM8A1Q9UBU6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms