Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC6Q9UBN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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