Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC4Q9UBN4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms