Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN3Q9P232 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN3Q9P232 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN3Q9P232 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN3Q9P232 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN3Q9P232 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN3Q9P232 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN3Q9P232 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms