Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms