Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms