Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCNT4Q9P109 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms