Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4Q9P0V3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms