Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC3Q9P0I2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC3Q9P0I2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms