Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLRF1Q9NZS2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms