Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms