Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGPEP1Q9NXJ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms