Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX95

SYBU, Syntabulin, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYBUQ9NX95 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYBUQ9NX95 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYBUQ9NX95 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms