Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLE1Q9NVX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLE1Q9NVX2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLE1Q9NVX2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLE1Q9NVX2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLE1Q9NVX2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms