Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD4Q9NVD3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SETD4Q9NVD3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms